Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Trim38Q5SZ99 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Trim38Q5SZ99 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Trim38Q5SZ99 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Trim38Q5SZ99 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Trim38Q5SZ99 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Trim38Q5SZ99 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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