Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYD0

Myo1d, Unconventional myosin-Id, mousemouse

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1dQ5SYD0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Myo1dQ5SYD0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Myo1dQ5SYD0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms