Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms