Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Utp18Q5SSI6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Utp18Q5SSI6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Utp18Q5SSI6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Utp18Q5SSI6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Utp18Q5SSI6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Utp18Q5SSI6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Utp18Q5SSI6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Utp18Q5SSI6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Utp18Q5SSI6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Utp18Q5SSI6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Utp18Q5SSI6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Utp18Q5SSI6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Utp18Q5SSI6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Utp18Q5SSI6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Utp18Q5SSI6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Utp18Q5SSI6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Utp18Q5SSI6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Utp18Q5SSI6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Utp18Q5SSI6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Utp18Q5SSI6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Utp18Q5SSI6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Utp18Q5SSI6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Utp18Q5SSI6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Utp18Q5SSI6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Utp18Q5SSI6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Utp18Q5SSI6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Utp18Q5SSI6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Utp18Q5SSI6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Utp18Q5SSI6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Utp18Q5SSI6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp18Q5SSI6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms