Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdh12Q5RJH3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdh12Q5RJH3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms