Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms