Protein–RNA interactions for Protein: Q5GFD5

Hs3st6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st6Q5GFD5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hs3st6Q5GFD5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hs3st6Q5GFD5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hs3st6Q5GFD5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hs3st6Q5GFD5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hs3st6Q5GFD5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms