Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtl5Q5DTT4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms