Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc84Q4VA36 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms