Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL05

Gm10488, Predicted gene 10488, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10488Q4KL05 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm10488Q4KL05 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms