Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL04

Gm5168, Predicted gene 5168, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5168Q4KL04 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm5168Q4KL04 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5168Q4KL04 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5168Q4KL04 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5168Q4KL04 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5168Q4KL04 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5168Q4KL04 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5168Q4KL04 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5168Q4KL04 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5168Q4KL04 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5168Q4KL04 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5168Q4KL04 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5168Q4KL04 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5168Q4KL04 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5168Q4KL04 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5168Q4KL04 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5168Q4KL04 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm5168Q4KL04 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm5168Q4KL04 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms