Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms