Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms