Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2D6

Krtap1-4, Keratin-associated protein 1-4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-4Q3V2D6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms