Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms