Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms