Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms