Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnaaf3Q3UYV8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms