Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU41

Scimp, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScimpQ3UU41 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ScimpQ3UU41 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ScimpQ3UU41 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms