Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
E130208F15RikQ3UPV3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms