Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrc4Q3UP24 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrc4Q3UP24 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrc4Q3UP24 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrc4Q3UP24 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrc4Q3UP24 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrc4Q3UP24 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms