Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skap2Q3UND0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms