Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdgfl2Q3UMU9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms