Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cobll1Q3UMF0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms