Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Parp3Q3ULW8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms