Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CrxosQ3UL53 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CrxosQ3UL53 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CrxosQ3UL53 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CrxosQ3UL53 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CrxosQ3UL53 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CrxosQ3UL53 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CrxosQ3UL53 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CrxosQ3UL53 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CrxosQ3UL53 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CrxosQ3UL53 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CrxosQ3UL53 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CrxosQ3UL53 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CrxosQ3UL53 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CrxosQ3UL53 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CrxosQ3UL53 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CrxosQ3UL53 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CrxosQ3UL53 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CrxosQ3UL53 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms