Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms