Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms