Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lmod2Q3UHZ5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmod2Q3UHZ5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms