Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp8Q3UD82 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Parp8Q3UD82 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms