Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hvcn1Q3U2S8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hvcn1Q3U2S8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hvcn1Q3U2S8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hvcn1Q3U2S8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hvcn1Q3U2S8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hvcn1Q3U2S8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hvcn1Q3U2S8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hvcn1Q3U2S8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hvcn1Q3U2S8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hvcn1Q3U2S8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hvcn1Q3U2S8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hvcn1Q3U2S8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hvcn1Q3U2S8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hvcn1Q3U2S8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hvcn1Q3U2S8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hvcn1Q3U2S8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hvcn1Q3U2S8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms