Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U1D9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3U1D9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U1D9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U1D9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3U1D9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U1D9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U1D9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms