Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Palb2Q3U0P1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Palb2Q3U0P1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms