Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms