Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWL2

Pip4p1, Type 1 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 4-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4p1Q3TWL2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pip4p1Q3TWL2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pip4p1Q3TWL2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pip4p1Q3TWL2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pip4p1Q3TWL2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pip4p1Q3TWL2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pip4p1Q3TWL2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pip4p1Q3TWL2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pip4p1Q3TWL2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pip4p1Q3TWL2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pip4p1Q3TWL2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pip4p1Q3TWL2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pip4p1Q3TWL2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pip4p1Q3TWL2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pip4p1Q3TWL2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pip4p1Q3TWL2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pip4p1Q3TWL2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pip4p1Q3TWL2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pip4p1Q3TWL2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pip4p1Q3TWL2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pip4p1Q3TWL2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pip4p1Q3TWL2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pip4p1Q3TWL2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pip4p1Q3TWL2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pip4p1Q3TWL2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pip4p1Q3TWL2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms