Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc136Q3TVA9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ccdc136Q3TVA9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms