Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms