Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtf3c3Q3TMP1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms