Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms