Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fubp3Q3TIX6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms