Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem104Q3TB48 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem104Q3TB48 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem104Q3TB48 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem104Q3TB48 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem104Q3TB48 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem104Q3TB48 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem104Q3TB48 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem104Q3TB48 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem104Q3TB48 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem104Q3TB48 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem104Q3TB48 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem104Q3TB48 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem104Q3TB48 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem104Q3TB48 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem104Q3TB48 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem104Q3TB48 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem104Q3TB48 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem104Q3TB48 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem104Q3TB48 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem104Q3TB48 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem104Q3TB48 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem104Q3TB48 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem104Q3TB48 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem104Q3TB48 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms