Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ap5b1Q3TAP4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms