Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3KNL4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3KNL4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3KNL4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3KNL4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3KNL4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3KNL4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3KNL4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms