Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR3

Pdss2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss2Q33DR3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdss2Q33DR3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdss2Q33DR3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdss2Q33DR3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms