Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms