Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb8Q0VBD0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms