Protein–RNA interactions for Protein: Q08EJ0

Plac8l1, PLAC8-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac8l1Q08EJ0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Plac8l1Q08EJ0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Plac8l1Q08EJ0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Plac8l1Q08EJ0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Plac8l1Q08EJ0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Plac8l1Q08EJ0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Plac8l1Q08EJ0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Plac8l1Q08EJ0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Plac8l1Q08EJ0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Plac8l1Q08EJ0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Plac8l1Q08EJ0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Plac8l1Q08EJ0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms