Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cntn3Q07409 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms