Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fmn1Q05860 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fmn1Q05860 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms