Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rcn1Q05186 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rcn1Q05186 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rcn1Q05186 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rcn1Q05186 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rcn1Q05186 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rcn1Q05186 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rcn1Q05186 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rcn1Q05186 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rcn1Q05186 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rcn1Q05186 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms